Το Πενταμελές Εφετείο Κακουργημάτων, που εκδίκασε την υπόθεση έκρινε ένοχο το «γαλάζιο» στέλεχος για το αδίκημα της απόπειρας εκβίασης και της παθητικής δωροδοκίας. Μάλιστα το Δικαστήριο του επέβαλε ποινή φυλάκισης 3,5 ετών αναγνωρίζοντάς του το ελαφρυντικό του σύννομου βίου. Σε πρώτο βαθμό είχε καταδικαστεί σε 8 χρόνια και τρεις μήνες φυλάκιση κατά συγχώνευση με αναστολή, δίχως το Δικαστήριο να του αναγνωρίσει κανένα ελαφρυντικό.
Υπενθυμίζεται ότι ο Χάρης Τομπούλογλου δικάστηκε σε δεύτερο βαθμό για το «φακελάκι» των 25.000 ευρώ το οποίο φέρεται να ζήτησε για να μην κηρύξει έκπτωτη σε διαγωνισμό διαφημιστική εταιρεία που είχε αναλάβει την προώθηση προγράμματος για την παιδική παχυσαρκία.
Ιδιαίτερη εντύπωση είχαν προκαλέσει όσα είχε ισχυριστεί στην απολογία του στο πρωτόδικο Δικαστήριο ο Χάρης Τομπούλογλου και επανέλαβε στο εφετείο. Το «γαλάζιο» στέλεχος είχε υποστηρίξει ότι ήταν θύμα πλεκτάνης, λόγω της σχέσης του με τη Ντόρα Μπακογιάννη.
«Δεν μπορούσαν να με φάνε αλλιώς γιατί διαχειριστικά δεν είχαν τίποτε στα χέρια τους. Στις 24-12-2013 με διέγραψαν από τη Νέα Δημοκρατία… και ο υπουργός (σ.σ.: Αδωνης Γεωργιάδης) ζήτησε από το διοικητικό συμβούλιο του νοσοκομείου παρανόμως να με αντικαταστήσουν» ισχυρίστηκε στην απολογία του ενώπιον του Τριμελούς Εφετείου Κακουργημάτων Αθηνών ο Χ. Τομπούλογλου.
«Εγώ δεν ήμουν του περιβάλλοντος Σαμαρά, αλλά της Ντόρας Μπακογιάννη. Υπήρχε σύστημα που μεθόδευε την απομάκρυνσή μου από το νοσοκομείο. Δυο μήνες μετά, ο δεσπότης της Γλυφάδας κατήγγειλε ότι ο υπουργός Υγείας (σ.σ.: Αδ. Γεωργιάδης) τον εκβίασε να παραιτηθεί. Η κάθε κομματική και εσωκομματική εξουσία έχει τον δικό της τρόπο φέρεσθαι. Μέσω εμού ήθελαν να καταστρέψουν έναν εσωκομματικό τους αντίπαλο, στον οποίο εγώ ήμουν προσκείμενος. Αντί να με θέσουν σε αργία όπως έπρεπε να κάνουν, ο ίδιος ο υπουργός Υγείας ζήτησε την απομάκρυνσή μου. Όταν δεν μπορούσαν να βάλουν δικούς τους σε θέσεις, τότε εξόντωναν τους αντιπάλους» είχε υποστηρίξει ο «γαλάζιος» Τομπούλογλου.